四部植物药一类，根据植物的性能、形态、及其生长的环境，区别为草部、谷部、菜部、果部、木部等5部；草部又分为山草、芳草、醒草、毒草、水草、蔓草、石草等小类动物一类，按低级向高级进化的顺序排列为虫部、鳞部、介部、禽部、兽部、人部等6部还有服器部这种分类法，已经过渡到按自然演化的系统来进行了从无机到有机，从简单到复杂，从低级到高级，这种分类法明显含有生物进化的思想，受到达尔文的高度重视达尔文在《动物和植物在家养下的变异》一书中，引用了《本草纲目》中关于鸡的七个品种和金鱼家化的资料尤其对植物的科学分类，要比瑞典的分类学家林奈早二百年
《本草纲目》广泛涉及医学，药物学，生物学，矿物学，化学，环境与生物，遗传与变异等诸多科学领域它在化学史上，较早地记载了纯金属、金属、金属氯化物、硫化物等一系列的化学反应同时又记载了蒸馏、结晶、升华、沉淀、干燥等现代化学中应用的一些操作方法李时珍还指出，月球和地球一样，都是具有山河的天体，“窃谓月乃阴魂，其中婆娑者，山河之影尔”《本草纲目》不仅是我国一部药物学巨著，也不愧是我国古代的百科全书正如李建元《进本草纲目疏》中指出：“上自坟典、下至传奇，凡有相关，靡不收采，虽命医书，实该物理”受到达尔文的高度重视达尔文在《动物和植物在家养下的变异》一书中，引用了《本草纲目》中关于鸡的七个品种和金鱼家化的资料尤其对植物的科学分类，要比瑞典的分类学家林奈早二百年
《本草纲目》广泛涉及医学，药物学，生物学，矿物学，化学，环境与生物，遗传与变异等诸多科学领域它在化学史上，较早地记载了纯金属、金属、金属氯化物、硫化物等一系列的化学反应同时又记载了蒸馏、结晶、升华、沉淀、干燥等现代化学中应用的一些操作方法李时珍还指出，月球和地球一样，都是具有山河的天体，“窃谓
《本草纲目》编写后，李时珍希望早日出版，为了解决《本草纲目》的出版问题，70多岁的李时珍，从武昌跑到当时出版业中心南京，希望通过私商来解决由于长年的辛苦劳累，李时珍最终病倒在床，病中嘱咐他的孩子们，将来把《本草纲目》献给朝廷，借助朝廷的力量传布于世可惜李时珍还没有见到《本草纲目》的出版，就与世长辞了这年（1593年），他刚满76岁
不久，明朝皇帝朱诩钧，为了充实国家书库，下令全国各地向朝廷献书，李时珍的儿子李建元，将《本草纲目》献给朝廷朝廷批了“书留览、礼部知道”七个字，就把《本草纲目》搁置一边后来仍在南京的