优化结构、提高水平上
虽然当时对高等教育的发展存在争议，不过高等教育的改革开始得到推进，其中影响最大的有两点，一个就是确定了高等教育收费改革，这项改革从八九年开始，到九四年扩大试点，九七年开始统一实行，高等教育学费改革以后，一定程度上减轻了国家对于高等教育发展的负担，为高校扩招奠定了基础。
另外一件事就是部分高校开启了第一次大合并，当时高等教育基本格局是教育部一套，行业主管部门一套、地方一套，也就是教育部下面管理一部分高校，铁道部、邮电部、水利部、纺织部、电子部、石油部等等都各自管理一部分高校，各省、市又管理一部分高校。像行业部委下属的这些高校，刚开始的时候专业特色比较鲜明，但是在之前的高等教育规模扩大的过程中，又开设了许多其他专业。
这就造成低水平重复建设；专业偏窄、科类单一，办学质量和效益差；高校规模偏小，而且小而全。因此，先是一些地方按优势互补的原则，对当地高校结构进行了调整，出现了由多所高校合并重组的地方大学，后来形成了“共建、调整、合作、合并”的高校调整改革思路。1998年撤销9个行业主管部门和1999年5个军工总公司改革，又有118所普通高校、106所成人高校和几百所中专、技校等需要调整，这也是2000年前后高校合并高潮的一个重要原因。
而在这一波高校调整中，高校录取人数也有一定的增加，九二年全国普通高校的招生人数比前一年增加了十三万，达到了万，九三年增加到了92万，九七年第一次突破100万，九八年达到了108万，录取率达到了%！
而今年启动的扩招，招生人数达到了160万，比九八年增加了52万人，增幅高达近百分之五十，总体录取率一举突破百分之五十。
但这还是增加最多的，从九九年开始，内地高校开始了狂飙突进，2000年高考录取人数再次增加了61万人，达到221万人；2001年增加了40万人，录取260万人，2002难再次增加了60万人，录取320万人；2003年增加62万人，录取382万人；2004年、2005年都增加了60万人左右，一直到2006年，当年录取人数达到530万，比前一年增加了26万人，其后数年，每年都增加30万人左右，到了2011年开始，又逐渐下降到20万人、10万人，高校每年的录取人数突破了700万，高考录取率逼近80%！不管是总量还是录取率，都已经非常高。
从1998年录取108万人，到2008年录取600万人，十年时间，内地高校的招生