、鼠疫”这三种最烈的疫病之上排在这三种疾病之前的便是疟疾，只不过被欧阳轩用黄花蒿提取的汁液治住了这三种病专播性极强、死亡率高，常常给一个地区带来灭顶之灾蒙古人西征带到欧洲“黑死病”，前后几次爆发使几千万人死亡，差点将欧洲文明摧毁，这黑死病便是鼠疫天花也是如此，人人畏之如虎避之不及，印第安文明便毁于西班牙殖民者带去的天花、流感等疾病霍乱虽然不如前两种瘟疫凶险，致死率也稍低，但爆发的频次密传播途径也多，其上吐下泻常污染水源对付传染病最有效方法是预防而不是治疗，实际上这三种传染病并没有特效药故在防治瘟疫研讨会上欧阳轩提出了三个防治途径：消灭传染源、切断传播途径、对症治疗
霹雳军在攻打彭山城之时，城中便发生了霍乱在欧阳轩的命令下，城中居民全被迁到了小山沟进行隔离并进行了对症治疗，又对城内城外进行了彻底的消毒，使得疫病控制在了一定范围，也大大降低了死亡率在总结此次经验得失的基础上，唐顺便在李爽和鲁德之的大力支持下，大力推动环境整治和个人卫生的宣传，甚至还出台了卫生不达标要被罚做短期苦役的法令，形成了人人讲卫生的氛围在霹雳军辖区内，蓬头垢面外出或者身上有跳蚤被视为极不体面之事事实证明这种应对措施对霍乱颇有效果，在霹雳军辖区内虽偶有爆发，但很快便被扑灭
除此之外，霹雳军还大量养猫霹雳军粮仓为了防潮主体由木头，其余部分由水泥浆彻，算得上十分牢固，却仍经不过老鼠日复一日的啃咬，养猫能从鼠口中夺回宝贵的粮食欧阳轩亲自下令养猫是因为老鼠是鼠疫杆菌的宿主，也是移动的专染源蒙古人活动的草原地带是鼠疫病的高发区，南下的蒙古骑兵也将传染源带到了汉地更可恶的是蒙军作战也常使用生物战，即将病死者的尸体用投石机抛入敌方的城军，以污染水源和粮食，从而达到不战而胜的目的事实上，在绵水前线，杨文安部发生瘟疫后，蒙军也曾企图将病死的新附军尸体抛过来，却被霹雳军挫败了
对付天花病毒，欧阳轩提出的牛痘接种法是最好的预防手段由于牛痘病毒和天花病毒共有交叉反应抗原，所以可以诱发机体产生自动免疫以预防天花这项技术是从感染天花的牛身上取出脓汁和痂皮，接种到健康人的身上使之获得免疫力事实上霹雳军早在去年便研发出了这种技术，余柱带到流求的士兵和技术人员便是第一批接种者只不过霹雳军牛只缺乏，不仅要用于耕地也用于在矿山和工厂作为动力，实在腾不出多少来牛来用于提取疫苗牛是重要的战略物资，但购买要比战马容易的多，故经过一年贸易已积累